Межшкольный учебно-производственный  комбинат    был создан в 1978 году для организации трудового обучения и воспитания учащихся средних школ на основе производительного труда.

В сентябре 1992 г. Межшкольный учебно-производственный комбинат Октябрьского района  был   объединен с Межшкольным учебно-производственным комбинатом Советского района и стал именоваться «Межшкольный городской учебно-производственный комбинат № 1» на основании приказа № 346 Управления образования Администрации г. Улан-Удэ. 

На основании Постановления Правительства Российской Федерации от  30 декабря 1999 года № 1437 «Об утверждении Типового положения о межшкольном учебном комбинате» Межшкольный учебно-производственный комбинат № 1  г. Улан-Удэ был переименован в Межшкольный учебный комбинат № 1 г. Улан-Удэ. 

Муниципальное общеобразовательное учреждение «Межшкольный учебный комбинат № 1 г. Улан-Удэ» переименовано в Муниципальное бюджетное образовательное учреждение «Межшкольный учебный комбинат № 1 г. Улан-Удэ» на основании приказа Комитета по образованию  № 137 от 23.03.2011 г.

На основании Приказа Комитета по образованию № 841 от 24.08.2015 г.  Муниципальное бюджетное образовательное учреждение дополнительного образования «Межшкольный учебный центр г. Улан-Удэ»   был создан путем изменения существующего    Муниципального бюджетного образовательного учреждения «Межшкольный учебный комбинат № 1 г. Улан-Удэ».